Informações sobre o curso

• Entrega do questionário: 28/02/2008
• Horários do plantão de dúvidas on-line: segunda-feira(11h00-12h00)
• E-mail (prguima [at] ifi.unicamp.br)
• Gtalk (prguima {at] gmail.com)
• MSN (paulocnus [at] hotmail.com)
• Skype (paulo.guima)

Aulas

• Introdução: sistemas ecológicos como redes complexas
• Sugestão de leitura: Proulx, S.R., D. E. L. Promislow, P. C. Phillips. 2005, Network thinking in ecology and evolution. TREE 20:345-353

• Conectividade e métricas de especialização
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: matriz1.txt, matriz1.xls, matriz2.txt
• Sugestão de leitura: Jordano, P., J. Bascompte, J.M. Olesen. 2003. Invariant properties in coevolutionary networks of plant-animal interactions. Ecology Letters 6: 69-81.

• Assimetrias e aninhamento
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: matriz3.xls, matriz4.txt
• Sugestão de leitura (1): Vázquez D. P. , M. A. Aizen. 2004. Asymmetric specialization: a pervasive feature of plant-pollinator interactions. Ecology 85: 1251-1257.
• Sugestão de leitura (2): Bascompte, J., P. Jordano, P., C. J. Melián, J.M. Olesen. 2003. The nested assembly of plant-animal mutualistic networks. PNAS USA 100: 9383-9387.

• Compartimentalização
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: matriz5.mat, modular.dat
• Sugestão de leitura: Guimaraes, P. R., V. Rico-Gray, P. S. Oliveira, T. J. Izzo, S. F. dos Reis, J.N. Thompson. Interaction intimacy affects structure and coevolutionary dynamics in mutualistic networks. Current Biology 17: 1797-1803.

• Centralidade
• Aula prática

• Força de interação
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: matriz5.txt
• Sugestão de leitura: Bascompte, J., Jordano, P., J.M. Olesen. 2006. Asymmetric coevolutionary networks facilitate biodiversity maintenance. Science 312: 431-433.

• Bases biológicas da estrutura de redes ecológicas
• Sugestão de leitura: Olesen, J., P. Jordano. 2002. Geographic patterns in plant-pollinator mutualistic networks. Ecology 83: 2416-2424.
• Modelagem matemática
• Sugestão de leitura: Williams, R. J., N. D. Martinez. 2000. Simple rules yield complex food webs. Nature 404: 180-183.
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: bio.xls, D1.mat, D2.mat, D3.mat,I1.mat,I2.mat, I3.mat

• Extinção e doenças
• Sugestão de leitura: Rezende, E., J. E. Lavabre, P. R. Guimaraes, P. Jordano, J. Bascompte. 2007. Non-random coextinctions in phylogenetically structured mutualistic networks. Nature. 448: 925-928.
• Aula prática
• Arquivos para a aula prática: rede1.txt, rede2.txt, seed.in

Redes disponíveis para o projeto

• Dados próprios
• Interaction Web Database de Diego Vázquez
• Lagartas e plantas hospedeiras da Costa Rica
• Teias tróficas em formato Pajek
• Teias trófica e redes mutualísticas de Jordi Bascompte
• Meus bancos de dados, por favor me escreva

Referências e dicas

• Desenho de redes bipartidas para artigos científicos
• Como importar uma matriz animal-planta em Excel para o Pajek?
• Como importar uma matriz animal-planta em Excel para o Nestedness Temperature Calculator?
• Como calcular a centralidade de uma espécie em uma rede
• Exemplo de manuscrito como guia para o relatório
• Manuscrito resultante do curso: Redes Complexas em Ecologia - UNICAMP (2005)

Programas

• ANINHADO
• Nestedness Temperature Calculator
• Pajek

Locais onde este curso já foi ministrado

• UNICAMP - Campinas (5 dias - 11 e 15 de Fevereiro de 2008). Curso parte do Programa de Pós-graduação em Ecologia
• UNESP - Rio Claro (2 dias - 29 e 30 de Novembro de 2007). Curso parte do Programa de Pós-graduação em Biologia Vegetal
• UFPR - Curitiba (4 dias - Julho de 2007). Curso parte do Programa de Pós-graduação em Ecologia
• UNESP - São José do Rio Preto (2 dias - Abril de 2007). Curso parte do Programa de Pós-graduação em Biologia Animal
• UFSCar - Sao Carlos (2 dias - Março de 2007). Curso independente associado ao Departamento de Botânica
• UNICAMP - Campinas (Segundo semestre de 2005 ). Curso parte do Programa de Pós-graduação em Ecologia e ministrado em colaboração com o Prof. Dr. Sérgio Furtado dos Reis. (nome antigo do curso: "Redes Complexas em Ecologia")